سیستم لایه نشانی در خلاء برای ایجاد لایه های نانومتری ، ایجاد اتصالات الکتریکی بسیار ظریف در حوزه نانو تکنولوژی و ​میکرو الکترونیک بسیار قابل استفاده می باشد.
اصلی ترین کاربرد این دستگاه به عنوان پوشش دهنده نمونه های عایق به منظور مشاهده آنها با میکروسکوپ الکترونی (SEM) می باشد. همچنین در صورتی که دستگاه خریداری شده مجهز به لایه نشان کربن هم باشد، از آن می توان برای آماده سازی نمونه ها به منظور آنالیز با اشعه ایکس (EDXA ) استفاده کرد.

یکی دیگر از کاربردهای این دستگاه در آزمایشگاه های لایه نشانی، نانو تکنولوژی و الکترونیک بوده و ابزار آموزشی بسیار مناسبی برای آشنا نمودن دانشجویان و دانش آموزان با مقوله خلأ، پلاسما و لایه نشانی می باشد.